Kacang Mesoamerika Berhasil Di-dekodekan

Pengurutan genom kacang  tidak hanya akan menjadi kunci untuk peningkatan produksi kacang tetapi juga untuk konservasi varietas genetik Ibero-Amerika yang lebih baik.

  • Sebuah tim  ilmuwan  Ibero-Amerika mendekodekan berbagai genom kacang  Mesoamerika bertepatan dengan perayaan Tahun Internasional Pulsa, yang ditetapkan oleh PBB.
  • Mengurutkan sumber umum dari protein nabati bagi orang-orang di seluruh dunia akan menjadi kunci tidak hanya untuk meningkatkan produksi kacang tetapi juga untuk konservasivarietas genetik Ibero-Amerika yang lebih baik.
  • Temuan ini diterbitkan dalam jurnal Genome Biology.

Kacang (Phaseolus) adalah salah satu tanaman tertua di dunia. Tanaman itu dijinakkan di Amerika ribuan tahun yang lalu, dan bersama-sama dengan jagung dan singkong, telah menjadi tanaman pokok di seluruh dunia. Menurut studi oleh Organisasi Pangan dan Pertanian (FAO), kacang umum adalah pangan bijian (pulsa) yang paling penting, yang mewakili 50% dari biji-bijian kacang-kacangan yang dikonsumsi di dunia, yang merupakan diet terpenting  lebih dari 500 juta orang. Tanaman ini diproduksi di Amerika Latin, Afrika, Timur Tengah, China, Eropa, Amerika Serikat dan Kanada. PBB telah menunjuk 2016 sebagai Tahun Internasional Pulsa untuk meningkatkan kesadaran masyarakat tentang manfaat gizi pangan bijian sebagai bagian dari produksi pangan yang berkelanjutan yang bertujuan menuju ketahanan pangan dan gizi.

Hari ini tim Ibero-Amerika ilmuwan, dari Argentina, Brasil, Meksiko, dan Spanyol atas inisiatif  dari The Ibero-American Programme for Science and Technology for Development (CYTED), telah berhasil mendekodekan genom kacang umum Mesoamerika (Phaseolus vulgaris) . Temuan ini dilaporkan dalam edisi terbaru jurnal Biology Genome. Proyek ini dipimpin oleh Alfredo Herrera-Estrella dari National Laboratory of Genomics for Biodiversity, Irapuato, Mexico, Roderic Guigó, koordinator program di Centre for Genomic Regulation dan dosen di Universitat Pompeu Fabra, dan Toni Gabaldon, profesor riset ICREA dan pemimpin kelompok di Centre for Genomic Regulation di Barcelona, ​​Spanyol,

Genom tersebut berisi informasi sifat menurun yang ada di dalam sel organisme hidup dan menentukan karakteristik biologisnya. Penyelidikan sistematis genom tanaman akan membantu meningkatkan pendekatan pertanian baik tradisional maupun bioteknologis. Hal ini juga akan memberikan andil dalam meningkatkan fitur kunci tanaman seperti ketahanan terhadap kekeringan atau kualitas gizi dari bijinya, dan memperluas kemungkinan penggunaan tanaman tidak hanya sebagai pangan tapi juga di industri.

Tim PhasibeAm memilih galur kacang Mesoamerika khusus untuk menurutkan genom (BAT93), mengingat relevansinya dengan produksi varietas-varietas yang saat ini digunakan secara komersial. Tim tersebut membangun platform teknologi yang kuat yang memuncak dengan pengurutan dan perakitan dari 620 juta pasangan dasar, yang akan menjadi setara dengan “surat” dari genom. Sebanyak 30.491 gen dalam genom diidentifikasi  dan ilmuwan juga menganalisis pola ekspresinya, yang berarti bahwa mereka mempelajari “kapan” dan “di mana” gen tersebut bersifat fungsional. Selain itu, mereka juga mengamati dan menentukan peristiwa penting selama evolusi yang telah membentuk tanaman kacang sebagaimana kita kenal sekarang.

“Urutan genom kacang, baik  kacang varietas Andean, yang sebelumnya telah diurutkan, maupun kacang varietas Mesoamerika, pasti akan memberikan andil dalam identifikasi gen-gen yang terlibat satu sama lain dalam ketahanan terhadap penyakit, kekeringan dan garam, fiksasi nitrogen, pembentukan sel-sel reproduksi dan kualitas benih, ” kata Roderic Guigó, koordinator program Bioinformatics and Genomics di  Centre for Genomic Regulation di Barcelona, ​​Spanyol. Dalam fase kedua proyek tersebut, genom dari setidaknya selusin varietas  kacang lain  dan beberapa kerabat dekat varietas tersebut akan diurutkan. Hal ini akan memungkinkan identifikasi gen-gen yang berhubungan dengan domestikasi. “Ini adalah contoh bagaimana bioinformatika dan sekuensing genom akan memberikan kontribusi untuk menghasilkan varietas-varietas dengan kualitas tinggi dan  lebih produktif dari tanaman yang telah menjadi penting untuk konsumsi manusia”, tambah Alfredo Herrera-Estrella, kepala kelompok Fungal Development and Gene Expression di National Laboratory of Genomics for Biodiversity, Irapuato, Meksiko.

The PhasIbeAm proyek, yang bertujuan untuk menurutkan kacang Mesoamerika umum, diluncurkan pada tahun 2009 oleh  Iberoamerican Program of Science and Technology for Development (Programa Iberoamericano de Ciencia y Tecnología para el Desarrollo, CYTED), dengan tujuan utama meningkatkan program pemuliaan spesies untuk mendapatkan varietas  kacang yang lebih produktif dari  dan konservasi yang lebih rasional dari lungkang gen spesies Mesoamerika  ini. Total anggaran dari proyek ini adalah US $ 2.482.000 yang didanai oleh Kementerian Sains, Teknologi dan Inovasi Produktif (MINCyT) Argentina, Dewan Nasional Ilmiah dan Pengembangan Teknologi (CNPq) Brazil, Kementerian Ekonomi dan Daya Saing ( MINECO) Spanyol, Dewan Nasional Sains dan Teknologi (CONACYT) Meksiko, dan Iberoamerican Program of Science and Technology for Development (Programa Iberoamericano de Ciencia y Tecnología para el Desarrollo, CYTED).

Sumber:
The Mesoamerican bean decoded

This entry was posted in Berita Pertanian and tagged , , , , , , , . Bookmark the permalink.

Leave a Reply

Your email address will not be published. Required fields are marked *